В Школу для одаренных детей им. Чарльза Ксавьера и на Дженошу неожиданно приходит по письму одинакового содержания. В них говорится о том, что в определенном здании, некая Алиса заложила бомбу, которая сдетонирует ровно в три часа дня. Помимо этого, для остроты ситуации, рядом с бомбой находятся три четырехлетних девочки-мутантки. Когда бомба сдетонирует, девочек убьет взрывной волной. Остаточная волна накроет город и все мутанты находящиеся в Нью-Йорке станут обычными людьми.
С одной стороны, Люди-Х должны спасти девочек, с другой, Магнето не может допустить такого глобального обращения в мутантов. К тому же, обе стороны боятся, что может случиться что-то подобное, что когда-то случилось с сенатором Келли.
Обе команды следуют подсказкам Алисы в надежде успеть и спасти город.
На месте самого местоположения бомбы на самом деле лежит простая записка, а за Алисой скрываются Кристофер и Розмари, которые решили разнообразить этот обычный день и провести его как-то по-особенному. Но это ведь никому неизвестно.
По желанию игроков возможно объединение команд.